Bereits Anfang des 14. Jahrhunderts wird eine Kirche in Papferding erwähnt. Ein Visitationsprotokoll des Jahres 1560 vermerkt einen Altar in der Kirche, die damals ein schlichter gotischer Sakralbau gewesen sein wird. Im Juli 1682 wurde der Kirchturm abgetragen. Am 27. August 1682 wird die Baufälligkeit der Kirche beklagt, woraufhin wohl der Neubau veranlasst wurde.
Die am Chorbogen angebrachte Jahreszahl 1692 dürfte auf das Jahr der Fertigstellung des Kirchenbaus zu beziehen sein. Als Weihedatum ist das Jahr 1698 überliefert.

Im schlanken Dachreiter befinden sich zwei Glocken, die im Tonabstand einer Quarte erklingen